Сюжет пригодницького мультфільму «Феї: Таємниця піратського острова» розгортається навколо маленької феї на ім'я Заріна. Вона дуже цікава, і найбільший інтерес проявляє до головного багатства світу фей - чарівного пилку, завдяки якому ці крихітні створіння можуть літати, і робити будь-якого роду чарівні речі. 
Одна з головних заборон, яку шанують всі феї, це ніколи не експериментувати з пилком, тому що ніхто достовірно не знає, до яких наслідків це може призвести. Ось тільки Заріну це ніколи не зупиняло, і вона постійно ставила досліди на пилку. І ось одного разу, коли всі дізналися про її витівки, невгамовна фея дуже сильно поплатилася за свою цікавість - Заріні довелося покинути долину фей. 
Через рік в долині влаштовують фестиваль Пір Року з веселою розважальною програмою. У самий розпал святкування на фестиваль абсолютно непоміченою пробирається Заріна, і вдавшись до чарівництва, їй вдається вкрасти дуже сильний пилок. З цього моменту і починається все найцікавіше ...